Первое решение - просто забить на упрощения и решать полную задачу безо всяких упрощений и подразделений на фундаменты и не фундаменты. компы сегодня быстрые, можно себе позволить. вряд ли у Вас что-то монструозное. ну, будет считать на 10 минут, а 10 часов - ничего страшного, привыкните. Возможно потребуется решать оптимизационную задачу. Это Вам придётся доказывать, что Вы специалист, а не нам.
Второе решение - бить задачу на transient с мелким шагом. На шаге самостоятельно формируете или берёте с предыдущего этапа в нужных элементах (области) напряжения, деформации, скорости, перемещен