Ага, а вот теперь то и подходим к самому главному.
Часть JT без PMI потому что галочка сохранения PMI не стояла при сохранении prt (и прочие настройки в tessUG, про которые пишут выше, не были определены).
По-моему эта галочка сбрасывается при повторном запуске NX, как и галочка сохранения JT (могу наврать).
Чтобы они не сбрасывались - надо настройки по умолчанию переопределять.
И делать это на машинах всех пользователей, генерирующих контент (можно централизованно, наверное, организовать).
Если же при отсутствии единых настроек уже была нагенерирована ку